DNA提取的类型与基本原则

DNA提取的类型与基本原则

  DNA提取的类型与基本原则
  核酸提取通常是开启生物学研究的第一步,而且提取的核酸质量高低也是决定下游实验成败的关键因素之一,那么你知道DNA提取的类型与基本原则是什么吗?让我们一起来看看吧!
  一、核酸提取类型:
  1.总RNA提取
  总RNA中,75-85%为rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、5S rRNA、5.8S rRNA、miRNA、siRNA、小核RNA及核仁小分子RNA等组成。
  2.miRNA提取
  MicroRNAs(miRNAs)是小型的、高度保守的RNA分子,如小干扰RNAs(siRNAs),通过与他们的碱基配对调节其同源mRNA的分子表达,以预防通过各种机制的表达。他们已成为进行发育、细胞增殖、分化和细胞周期的重点监管机构。
  3.基因组DNA提取
  进行基因结构和功能研究以及基因诊断,通常要求得到的片段长度不小于100~200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。
  4.质粒抽提
  质粒抽提方法即去除RNA,将质粒与细菌基因组DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。
  二、DNA提取的基本原则
  1.保证DNA结构的完整性
  不同的下游实验对于DNA结构的完整性有所区别。如PCR、Southern杂交这一类实验基本保证所需片段的完整,而二代测序实验为了获得全面的序列信息对DNA的完整性要求更高。
  2.保证DNA的纯度
  去除对下游实验中酶分子有抑制作用的有机溶剂和高浓度金属离子,将蛋白质、多糖、多酚等生物大分子的污染降到低,去除其他核酸。
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你知道PCR引物设计原则是什么吗?

你知道PCR引物设计原则是什么吗?

PCR引物是人工合成的一段寡聚核苷酸。PCR中通常需要两种引物。一种与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补, 另—种与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。引物是PCR特异性反应的关键,因此,PCR的首要任务就是引物设计。引物设计的好坏,直接影响了PCR的结果。成功的PCR反应既要高效,又要特异性扩增产物。那么PCR引物设计的原则有哪些呢?让我们一起来看看吧!

引物设计的目的是在两个目标之间取得平衡:扩增特异性和效率。因此,引物的设计需要遵循以下原则

一、引物长度要适宜

一般,引物的长度为15-23bp,常用的长度为18-21bp。过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq 酶进行反应。过短则特异性差。

二、引物GC含量要适宜

1.引物3'端的碱基一般不用A,因为A在错误引发位点的引发效率相对比较高, 而其它三种碱基的错误引发效率相对小一些。

2.3'端防止连续三个CG,引物的GC含量一般为45-55%,过高或过低都不利于引发反应。

3.上下游引物的GC含量不能相差太大。

三、引物自身及引物之间不应存在互补序列

碱基要随机分布,且引物自身和引物之间不能有连续4个碱基的互补。否则引物自身会折叠成发夹结构或二聚体,从而影响引物与模板的复性结合。

四、引物5'端可以修饰,3'端不可修饰

1引物的5' 端决定着PCR产物的长度,它对扩增特异性影响不大。因此,可以被修饰而不影响扩增的特异性。引物5'端修饰包括:加酶切位点,加标记荧光,引入点突变、插入突变、缺失突变序列;引入启动子序列等。

2引物的延伸是从3'端开始的,不能进行任何修饰。

3在引物的5`端连接一对限制酶的识别序列,这样便于目的基因连接到载体上。

五、退火温度要适宜

退火温度高,扩增特异性强;退火温度低,扩增效率高。

原因:如果引物碱基数较少,可以适当提高退火温度,这样可以使PCR的特异性增加;如果碱基数较多,那么可以适当减低退火温度,使DNA双链结合。一对引物的退火温度相差4℃~6℃不会影响PCR的产率,但是理想情况下一对引物的退火温度是一样的。

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美国cellscript试剂盒提取也是有原则的,你可知!

美国cellscript试剂盒提取也是有原则的,你可知!    美国cellscript试剂盒其基本方法是将已知的抗原或者抗体吸附在固相载体表面,并保持其免疫活性。然后抗原或抗体与某种酶连接成酶标抗原或抗体,这种酶标抗原或抗体既保留其免疫活性,elisa试剂盒又保留酶的活性。在测定时,把受检标本(测定其中的抗体或抗原)和酶标抗原或抗体按不同与固相载体表面的抗原或抗体起反应。

  美国cellscript试剂盒配有进行分析或测定所必需的全部试剂的成套用品,操作方便,而且排除的人为配置药品的误差,因为全部试剂都是成套出现,使操作更加标准,不会有浪费的现象。
  美国cellscript试剂盒提取的原则
  1、保证核酸一级结构的完整性(因为遗传信息全部储存在核酸一级结构中,故完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的基层)。
  2、排除其它分子(如蛋白质、多糖,、脂类、有机溶剂等)的污染,使下游试验顺利进行。
  试剂盒提取的原理和方法
  DNA与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺旋管状结构,即染色丝,染色丝再与许多非组蛋白形成染色体。染色体存在于细胞核中,
  外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。

试剂盒提取的原则

试剂盒提取的原则    试剂盒提取的原则

  试剂盒的用途:用固相化的、已标记的饵蛋白或标签蛋白(生物素-、PolyHis-或GST-),从细胞裂解液中钓出与之有相互作用的蛋白质。酵母双杂交后,验证已知的“诱饵”蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用关系。从体外转录或翻译体系中检测出蛋白质相互作用。
  试剂盒特点:提供了可用于发现蛋白质相互作用的一套完整、易用、经济的方案。用普通的试验仪器和试剂(如离心机、Mini-Gel、蛋白质染色)即可完成整个实验。适用于单个或多个样品。灵活的“诱饵-捕获”方式,盐离子、变性剂浓度可调,对于弱的蛋白质相互作用也适用。一天之内“捕获”和检测可能与“诱饵”蛋白相结合的蛋白。回收相互作用的蛋白质复合物。
  试剂盒配有进行分析或测定所必需的全部试剂的成套用品,操作方便,而且排除的人为配置药品的误差,因为全部试剂都是成套出现,使操作更加标准,不会有浪费的现象。
  试剂盒提取的原则
  1、保证核酸一级结构的完整性(因为遗传信息全部储存在核酸一级结构中,故完整的一级结构是保证核酸结构与功能研究的基层)。
  2、排除其它分子(如蛋白质、多糖,、脂类、有机溶剂等)的污染,使下游试验顺利进行。
  试剂盒提取的原理和方法
  DNA与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺旋管状结构,即染色丝,染色丝再与许多非组蛋白形成染色体。染色体存在于细胞核中,
  外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。