甲基化 DNA 检测：MSP-ZEWB 提取亚硫酸氢钠处理 DNA
检测DNA 甲基化需多个技术环节：制备基因组 DNA 样品；DNA的片段化，再用亚硫酸氢钠处理，使未甲基化 C 转变成 U 而甲基化 C 保持不变； 纯化亚硫酸氢钠处理后的痕量DNA；用qPCR 或二代测序等检测。
MSP-ZEWB 提取基因组DNA 效力与常用硅醇磁珠相当。 MSP-ZEWB 纯化亚硫酸氢钠处理后痕量 DNA 的片段耐受高浓度阴离 子干扰 (参见：IntJBiolMacromol2018;120(B):2234-2241)。
MSP-ZEWB 提取短链核酸效力强，属于其优势应用之一。
磁珠特点
核-壳结构：聚合物包裹纳米磁芯
超顺磁纳米 Fe3O4颗粒质量占比高
磁响应速度不逊于常用竞品
表面有小体积兼性离子对修饰层
蛋白及中性小分子非特异性吸附低
表层吸附大量水，分散稳定性好
分离性能标定值批间波动<6%
液体活检提取 cfDNA：两性解离离子交换磁珠 MSP-ZEWB
MSP-ZEWB 对水溶蛋白非特异吸附低，提取细胞外游离核酸时可不去 蛋白(耐受残留细胞干扰)，提取效力强于硅醇磁珠，适合血浆、血清、羊 水中循环非细胞DNA(Circulatingcell-freeDNA,cfDNA)。需长时间保存所 提取的 cfDNA 则宜变性蛋白，终浓度>3.0M 盐酸胍适用。
吸附核酸时 MSP-ZEWB 对核酸片段长度的选择性与硅醇磁珠相反： 对短链核酸效力强于长链核酸。选择提取短链核酸为MSP-ZEWB 特色。 提取cfDNA 备选流程：用蛋白酶 K 室温处理液体样品约 10min 灭活 其中DNA 酶；用吸附缓冲液调节混合物 pH 到 3.5~4.2 并稀释以降低离子 强度，再加磁珠吸附 cfDNA；洗涤磁珠，后洗脱所吸附的 cfDNA。
提取样品中短链 cfDNA，是 MSP-ZEWB 的优势应用之一。
提取痕量样品中核酸：两性解离离子交换磁珠 MSP-ZEWB
两性解离离子交换磁珠 MSP-ZEWB 为明星产品，表面有兼性离子对 修饰层，脂肪族羧基、脂肪族氨基及咪唑基组成的两性解离基团；pH~4.2 经静电吸引结合阴离子(核酸)，pH~8.6 时静电排斥洗脱阴离子(核酸)。
两性解离离子交换磁珠结合样品中带同种电荷离子时基本无选择性，
但磁珠与核酸之间的静电吸引显著强于硅醇磁珠与核酸之间的氢键。
提取痕量样品(如脱落细胞)中核酸是 MSP-ZEWB 的优势应用之一。 提取RNA 备选流程：终浓度>3.0M 盐酸胍变性样品中蛋白；吸附缓 冲液稀释并调节混合物pH 到 3.4~4.2，加磁珠吸附 RNA；洗涤、洗脱RNA； 如需去除所有 DNA，则用无 RNA 酶的 DNA 酶 I 处理所得 RNA，再提取。 提取DNA 时用蛋白酶 K 替换盐酸胍，用于灭活 DNA 酶。
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各种常规分子量标准的电泳图如下。每种 Marker 产生的条带数以及片段大小等详细信息可以查看说明书或登陆网站 www.neb-china.com，www.neb.com 查询。
pBR322 DNA-BstNI 消化、pBR322 DNA-MspI 消化和 ΦX174 DNA-HaeⅢ消化的浓度为 1,000 μg/ml。Lambda DNA-BstEⅡ消化、Lambda DNA-HindⅢ消化和 Lambda DNA-Mono Cut Mix 的浓度为 500 μg/ml。
