NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel 货 号 #E6627L NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/靶向富集

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#E6627L
24 reactions
21,599.00

#E6627S
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#E6627X
96 reactions
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产品优势

   Generate full (100%) coverage of all protein coding regions in BRCA1 and BRCA2 genes

   Obtain highly uniform sequencing across exon targets- 100% of base pairs in panel have coverage

       greater than 20% of the mean target coverage

   Maximize efficiency with a 1-day workflow that combines highly specific enrichment with library

      preparation

   Produce high depths of target coverage across a wide range of DNA input amounts for germline and

      somatic variant calling

概述

The NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Panel enriches the complete exon content of BRCA1 and BRCA2

genes for next-generation se­quencing analysis. NEBNext Direct employs a unique hybridization-based

enrichment workflow that hybridizes baits directly to genomic DNA, without the need for upfront library

preparation. The BRCA1/BRCA2 panel demonstrates extremely high specificity and unmatched coverage

uniformity across a wide range of DNA inputs, allowing highly sensitive calling of germline and somatic

variants while maximizing sequencer efficiency.

 

Figure 1. NEBNext Direct Workflow.

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

试剂盒组份

NEBNext Sample Purification Beads
NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Baits
NEBNext Direct® Bead Prep Buffer
NEBNext Direct® Hybridization Buffer
NEBNext Direct® dA-Tailing Buffer
NEBNext Direct® Adaptor Ligation Buffer
NEBNext Direct® Cleaving Buffer  
NEBNext Direct® Hybridization Wash (HW) 
NEBNext Direct® Bead Wash 1
NEBNext Direct® Bead Wash 2 
NEBNext Direct® 3´ Adaptor  
NEBNext Direct® 5´ UMI Adaptor 
NEBNext Direct® dA-Tailing Enzyme
NEBNext Direct® Ligase  
NEBNext Direct® 5´ Blunting Enzyme Mix 
NEBNext Direct® Cleaving Enzyme Mix 
NEBNext Direct® Q5 Master Mix
NEBNext Direct® FFPE Phosphorylation Enzyme
NEBNext Direct® Streptavidin Beads 4
NEBNext Direct® Hybridization Additive -20
NEBNext Direct® 5´ Blunting Buffer 4
NEBNext Direct® 3´ Blunting Enzyme Mix

NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Resources

  • GRCh37hg19 Bed Files for the NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel
  • GRCh38hg38 Bed Files for the NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel
  • Protocol for NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Panel (E6627)

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel 货 号 #E7000L NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/靶向富集

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#E7000L
24 rxns
39,109.00

#E7000S
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#E7000X
96 rxns
119,229.00

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产品优势

   可比对到目标区域的 reads 比例更高

   避免过度测序,减少每个样本的花费

   所 有 区 域 均 可 得 到 均 一 的 测 序 结果,无论 GC 含量多少

   将富集和文库制备流程相结合,1 天即可完成

   能够从有限及降解的 DNA 样品中得到高质量的文库,包括 FFPE 及 ctDNA

   区分分子重复,降低假阳性突变并提高敏感度

概述

 NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel 采用了一种全新的靶向富集方法,使其能够高特异性的杂交捕获 50 个基因中的 190 个常见癌症靶点。NEBNext Direct 技术与传统的液相杂交及多重 PCR 方法相比有着明显的优势。靶向富集与文库制备相结合,减少了实验所需时间,同时将样本的损失降到最低。能够与自动化设备兼容的 NEBNext Direct 使得对难以成功的样本基因组中目标区域的深度测序成为可能,从而能够发现及鉴定样本中的罕见突变。

 

NEBNext Direct 采用了快速杂交实验流程,将捕获与文库构建相结合

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

目标区域包括以下癌症相关基因

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

 NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

产品详细信息

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NEBNext Direct®基因分型解决方案样本制备试剂盒 货 号 #E9500B-S NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/靶向富集

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相关产品

NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒

概述

 NEBNext Direct® 基因分型解决方案具有低成本高效益、高通量等特点,通过对靶基因测序进行基因分型,可广泛应用于植物、动物和人类。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案将多重基因序列捕获富集技术与高效的二代测序相结合,从而为各种应用提供低成本高效益、高通量的基因分型。适用于 100-5000 Marker 范围,多达 96 个样本的预捕获结合双端检索引物,使得一次 Illumina® 测序,就可对 380 万个以上的基因进行分型。
 

产品描述

 适用于几百到几千个 Marker 基因分型的理想解决方案

多达 96 个样本的预捕获降低成本并简化操作流程
加入双端检索引物和唯一分子标签实现测序效率最大化
通过独特的靶基因捕获富集技术,实现无与伦比的目标覆盖均一性
精密的探针设计,避免 Marker 丢失
仅需 1 天的实验流程,可自动化,极大提高样本通量

96 个样本的质控后 Reads
 
NEBNext Direct®基因分型解决方案样本制备试剂盒            货   号                  #E9500B-S
 

 使用 SolCAP 公开提供的 2,309 个 Marker Panel 对 96 个番茄 DNA 样本进行富集,并结合 NEBNext Direct® 基因分型解决方案试剂盒做基因分型。图中显示了质控后的 Reads 数。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案在 96 个样本中显示了相似的覆盖度
 
NEBNext Direct®基因分型解决方案样本制备试剂盒            货   号                  #E9500B-S
图中显示了 96 个样本 2,309 个 SolCAP Markers 的平均 SNP 覆盖度。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。结果表明:NEBNext Direct® 基因分型解决方案在 96 个样本中显示了相似的覆盖度。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案对 96 个样本富集的特异性
NEBNext Direct®基因分型解决方案样本制备试剂盒            货   号                  #E9500B-S
 
 

图中显示了质控后的 Reads 数比对到目标区域的百分比,表明 NEBNext® Direct 基因分型解决方案在 96 个样本中都显示出高度特异性。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。

单个样本中 2,309 个 Marker 的平均覆盖度
 
NEBNext Direct®基因分型解决方案样本制备试剂盒            货   号                  #E9500B-S
2,309 个 SolCAP Markers 覆盖度的柱状图显示了目标富集和覆盖水平的均一性,该结果足以进行基因分型。这些数据来自与其它 95 个番茄样本混合杂交后的一个番茄样本。样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒 货 号 #E9530B-S NEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/靶向富集

NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒                              收藏

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#E9530B-S
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相关产品

NEBNext Direct® 基因分型解决方案样本制备试剂盒

概述

 NEBNext Direct® 基因分型解决方案具有低成本高效益、高通量等特点,通过对靶基因测序进行基因分型,可广泛应用于植物、动物和人类。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案将多重基因序列捕获富集技术与高效的二代测序相结合,从而为各种应用提供低成本高效益、高通量的基因分型。适用于 100-5000 Marker 范围,多达 96 个样本的预捕获结合双端检索引物,使得一次 Illumina® 测序,就可对 380 万个以上的基因进行分型。
 

产品描述

 适用于几百到几千个 Marker 基因分型的理想解决方案

多达 96 个样本的预捕获降低成本并简化操作流程
加入双端检索引物和唯一分子标签实现测序效率最大化
通过独特的靶基因捕获富集技术,实现无与伦比的目标覆盖均一性
精密的探针设计,避免 Marker 丢失
仅需 1 天的实验流程,可自动化,极大提高样本通量

96 个样本的质控后 Reads
 
NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒            货   号                  #E9530B-S
 

 使用 SolCAP 公开提供的 2,309 个 Marker Panel 对 96 个番茄 DNA 样本进行富集,并结合 NEBNext Direct® 基因分型解决方案试剂盒做基因分型。图中显示了质控后的 Reads 数。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案在 96 个样本中显示了相似的覆盖度
 
NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒            货   号                  #E9530B-S
图中显示了 96 个样本 2,309 个 SolCAP Markers 的平均 SNP 覆盖度。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。结果表明:NEBNext Direct® 基因分型解决方案在 96 个样本中显示了相似的覆盖度。

NEBNext Direct® 基因分型解决方案对 96 个样本富集的特异性
NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒            货   号                  #E9530B-S
 
 

图中显示了质控后的 Reads 数比对到目标区域的百分比,表明 NEBNext® Direct 基因分型解决方案在 96 个样本中都显示出高度特异性。每个样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。

单个样本中 2,309 个 Marker 的平均覆盖度
 
NEBNext Direct® 基因分型解决方案靶向富集试剂盒            货   号                  #E9530B-S
2,309 个 SolCAP Markers 覆盖度的柱状图显示了目标富集和覆盖水平的均一性,该结果足以进行基因分型。这些数据来自与其它 95 个番茄样本混合杂交后的一个番茄样本。样本起始量为 25 ng 纯化的番茄 DNA。样本加上标签标记后再进行杂交,文库在 Illumina® Miseq® 上测序,并设置程序:12 个碱基的唯一分子标签和 8 个碱基的样本标签用 Read 1 运行 20 个循环,目标基因用 Read 2 运行 75 个循环。