非小细胞肺癌具有JI端的免疫多样性!

非小细胞肺癌具有JI端的免疫多样性!

恶性肿瘤中,肺癌全球发病率和死亡率位居前列,特别是非小细胞肺癌(NSCLC占比高,且存在高度侵袭性异质性,而且组织学亚型复杂和突变特征明显。

肿瘤微环境异质性单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的进步下,也逐渐被解剖。但是单细胞RNA测序(scRNA-seq存在样本量有限,缺乏基因组数据长期随访数据,因此在分析肿瘤微环境生物异质性药物耐药性等方面较为片面。

NSCLC肿瘤微环境中,白细胞是重要的细胞类型,根据往期实验数据得出:中性粒细胞在瘤内驻留白细胞中占比8%-20%但是,单细胞RNA测序(scRNA-seq中性粒细胞方面的研究较少,因此,加强NSCLC 肿瘤微环境中中性粒细胞的研究,意义重大。

最近,奥地利因斯布鲁克医科大学的Zlatko TrajanoskiAndreas Pircher研究团队Cancer Cell发表题为《High-resolution single-cell atlas reveals diversity and plasticity of tissue-resident neutrophils in non-small cell lung cancer》的论文,研究发现:中性粒细胞(TRNs)亚群NSCLC的肿瘤微环境中具有不同的功能特性,尤其是,TRNs的基因标记与免疫检查点抑制剂治疗的不良预后相关。

论文首页截图

研究团队根据公开的scRNA-seq数据集,对比自己团队的NSCLC数据集(UKIM-V根据大数据,进行全面的分析,整合出一个全新的NSCLC单细胞核心图谱。在该图谱中,转录组数据为298(212NSCLC患者,86名对照者),肿瘤样本数据为364个(196个肿瘤样本168个非肿瘤)。212NSCLC患者中肺腺癌(LUAD156人,占比73.6%肺鳞状细胞癌(LUSC41人,占比19.3%

根据NSCLC核心图谱的研究结果跟流式细胞分析数据一致,说明:中性粒细胞群仅占所有细胞的1.5%,但是图谱里78%的中性粒细胞来自UKIM-V数据集,其中中性粒细胞分别占UKIM-V所有细胞的12%和所有白细胞的18%中性粒细胞表达的mRNA分子量极低发现是由于其半衰期较短,仅为7-10小时对比多种测序结果发现,BD Rhapsody平台捕获的mRNA分子数量要丰富得多因此可能更适合检测低mRNA含量的细胞。

结合上述结果,该研究团队利用BD Rhapsody平台测序的UKIM-V队列数据中性粒细胞的转录组特征进行进一步研究,发现:LUSC中中性粒细胞比例明显较高,而LUAD中巨噬细胞、CD4 T细胞、2型肺泡细胞、过渡型棒状细胞/2型肺泡细胞(transitional club/AT2)更为丰富

研究的总体流程和细胞类型

 根据患者肿瘤微环境浸润模式,该研究团队将NSCLC患者分为了四个类别:免疫荒漠型、B细胞优势型、髓系细胞优势型、T细胞优势型。其中,免疫荒漠型没有明显的免疫细胞浸润,但肿瘤细胞比例高;B细胞优势型主要为B细胞、浆细胞和肥大细胞;髓系细胞优势型主要为巨噬细胞和单核细胞;T细胞优势型主要为CD8 T细胞、CD4 T细胞和调节性T细胞。不同免疫表型也表现出具有差异性的细胞因子信号特征。

不同肿瘤免疫表型的细胞因子信号特征

 根据早期的研究结果发现,LUAD以炎症状态为主LUSC伤口愈合状态为主根据细胞细胞通信网络的差异,该研究团队进一步实验发现:LUADKDRVEGFR2血管内皮细胞生长因子受体2-VEGFA(血管内皮生长因子A通信上调为特征,通过促进血管生成,开启免疫抑制信号,而LUSC则以SPP1(分泌型磷蛋白1)和JAG-NOTCH信号通路上调为主要特征,前者促进肿瘤转移,后者通过募集中性粒细胞调节肿瘤免疫微环境。

细胞互作分析

 根据TCGA队列数据的分析,发现转录组与生存数据之间的关系:肿瘤B细胞的富集度与NSCLC患者的良好预后成正相关,而中性粒细胞则呈负相关CD8 T细胞亚型的分析显示,幼稚CD8 T细胞与良好预后呈正相关

TCGA数据中细胞组成和生存率的关系

  根据对NSCLCTRNs的异质性细胞亚群的鉴定发现:肿瘤相关中性粒细胞(TANs)和邻近正常组织相关中性粒细胞(NANs表达谱特征不同,且中性粒细胞是肿瘤微环境中VEGFA的主要来源,印证了TRNs重要的促血管生成作用

同时该研究团队还发现:TANs中凝集素型氧化低密度脂蛋白受体1LOX-1)表达升高,肿瘤组织中存在较多的LOX-1+细胞浸润,但在匹配的相邻的正常肺组织中未发现LOX-1+细胞浸润,说明LOX-1可能是一种特异性的TANs标记物。

为了深入解析TRNs不同亚群的异质性,研究团队继续对图谱中TRNs进行聚类分析,鉴定出了4TAN亚群和3NAN亚群

值得注意的是,TAN-2亚群CD274PD-L1/PDCD1PD-1)信号通路显著上调,提示了TANCD8 T细胞的免疫抑制作用,这与过去报道的中性粒细胞的富集与抗PD-1/PD-L1治疗无应答有关的结果一致。

为了确定TRNsNSCLC患者中的预后价值,研究团队分析NSCLC患者治疗前肿瘤的RNA-seq数据,这些患者经历了抗PD-L1抗体或化疗药单药治疗。结果显示,TRN基因标记与抗PD-L1治疗应答和生存预后呈明显负相关(p=0.003),但在化疗组中并不显著

TRN基因标记与免疫治疗应答和预后的关

  综上所述,这个研究从单细胞层面全面剖析NSCLC肿瘤微环境,一方面,分析了中性粒细胞群对肿瘤微环境中具有不同功能特性的TRNs亚群进行深入表征,另外一方面,弥补了基因组数据以及长期随访数据,揭示了中性粒细胞与免疫治疗抵抗和不良生存结局的关联,为后续开发中性粒细胞耗竭剂奠定了基础。

上海金畔生物科技有限公司提供肺癌细胞助力非小细胞肺癌的研究,为后续开发中性粒细胞耗竭剂助力。

品牌 产品名称 货号
Accegen
PC-9
ABC-TC0907
LK-2 ABC-TC0587
Lewis-Lung ABC-TC0585
LL/2(LLc1) ABC-TC0591
Human Lung Fibroblasts (Paracancerous) ABC-H0080X
Human Pulmonary Pericytes ABC-H0044X
Human Alveolar Macrophages ABC-H0034X
Human Pulmonary Alveolar Epithelial Cells ABC-TC3770
Human Type II Alveolar Epithelial Cells ABC-TC5515
GFP-Human Lung Fibroblasts-Adults

ABC-FC0040

美国Matreya LLC抗体的多样性是什么?

美国Matreya LLC抗体的多样性是什么?    美国Matreya LLC抗体是指机体由于抗原的刺激而产生的具有保护作用的蛋白质。它(免疫球蛋白不仅仅只是抗体)是一种由浆细胞(效应B细胞)分泌,被免疫系统用来鉴别与中和外来物质如细菌、病毒等的大型Y形蛋白质,仅被发现存在于脊椎动物的血液等体液中,及其B细胞的细胞膜表面。抗体能识别特定外来物的一个*特征,该外来目标被称为抗原。

  美国Matreya LLC抗体的多样性
  人血清中的抗体多种多样,B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上,可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面:
  1、外源性因素环境中抗原种类甚多,每种大分子抗原又有多种抗原表位,每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆,产生一种特异性抗体。
  2、内源性因素抗体多样性的另一个原因是由基因的结构及功能特征所决定的。编码人Ig重链及κ、λ型轻链的基因分别位于第14、2、22号染色体上。其中编码Ig重链的基因包括编码可变区的V、D、J及编码恒定区的C基因;编码Ig轻链的基因包括编码可变区的V、J及编码恒定区的C基因。每种基因片段是以多拷贝的形式存在,其中编码重链V区的VH、DH和JH的基因片段数分别为50、23和6个;编码K轻链V区的Vx和JK基因片段数分别为60和5个,编码入轻链V区的VX和J入基因片段数分别为30和7个。这些基因在胚系阶段以分隔的形式存在。在B细胞的分化发育过程中,这些基因片段发生重排和组合,从而产生数量巨大、能识别特异性抗原的BCR。每种具有特异性BCR的B细胞克隆可识别相应的抗原,产生一种特异性抗体。Ig基因重组是B细胞合成无数特异性抗体的主要原因。