NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA) 货 号 #E7395L NEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/接头 & 引物

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)                              收藏

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#E7395L
384 次反应
31,089.00

#E7395S
96 次反应
8,179.00

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相关产品:

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 RNA)

产品特点:

·接头引物可用于 PCR-free 的文库扩增 

 ·  高效稳定的连接效率

 ·  更灵敏地检测低频单核苷酸变异(SNV

 · 可支持更高通量

概述:

 用于 Illumina® 平台的 NEBNext® 多样本接头引物是 NEBNext® 文库制备系列产品的重要组成部分,有多种不同的产品可用于 NEBNext® 产品或其它标准的 Illumina® 平台兼容的文库制备流程。该产品经设计和优化,适用于包括 PCR-free 在内的 DNA 测序流程。这些独特的双端检索引物接头还分别包含一段唯一的分子标签序列(UMI,以便识别和删除扩增文库中的 PCR 错误或重复。提供 96 个独特的、预混的含有 UMIs 的接头引物,包装在一个一次性的密封着可穿刺的铝箔封板膜 96 孔板中。PCR 扩增需要的通用引物也包含在内。

可提供适用于 RNA 测序的 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头(NEB #E7416),也可提供单端、双端和 Unique 双端引物以及优化的接头。

产品描述:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)            货   号                  #E7395L

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)可实现更高的连接效率。A)以 100 ng250 ng 500 ng 的人 NA19240 基因组 DNACoriell Institute for Biomedical Research)为起始样本,使用 NEBNext® Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒(NEB #E6177)和图中相应供应商提供的接头引物制备文库,不进行 PCR 扩增。连接后,使用 SPRIselect 磁珠进行两轮纯化,使用 NEBNext® 文库定量试剂盒(NEB #E7630)对文库进行定量。B) 100 ng NA19240 基因组 DNA 为起始样本,使用 Ultra II FS DNA 文库制备试剂盒在 96 孔板中制备 90 个文库,供应商提供的 30 个接头引物如图所示,不进行 PCR 扩增。两轮磁珠纯化后,进行 qPCR 定量。

 

NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)            货   号                  #E7395L

 

NEBNext® 多样本接头引物试剂盒 1Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA可更灵敏地检测低频变异。AcroMetrix 肿瘤 Hotspot Control DNAThermo Scientific® #969056)作为突变 DNA 源(>500个突变,等位基因频率为 5-35%),以不同比例与 NA19240 基因组 DNA 混合,产生一系列不同的等位基因频率。使用 NEBNext® Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)和 NEBNext® Unique 双端 UMI 接头制备文库,并使用 Twist Bioscience® 152 个基因的定制 panel 对所有样本进行多重杂交捕获。文库使用 Illumina NovaSeq® 测序,Reads 降采样1.1 亿,并使用 BWA MEM0.7.17)比对至 hg38。在不使用 UMI 序列或构建 UMI 共有序列(Fgbio 0.8.1)的情况下,使用 MarkDuplicatesPicard 2.20.6)分析比对上的 reads。使用 Strelka22.9.10)从最终的 BAM 文件中分析体细胞突变。(A)当使用 UMIs 删除重复序列,所得的 SNV 总数和正确的数量都增加。(B)用 UMI 进行共有序列比较,能提高检测灵敏度。等位基因频率越低,UMIs SNV 检测中的优势就越大。

实验流程:

 NEBNext®多样本接头引物试剂盒 1(Unique 双端 UMI 接头,适用于 DNA)            货   号                  #E7395L