一文了解荧光标记肽核酸PNA

一文了解荧光标记肽核酸PNA

肽核酸 (Peptide Nucleic Acid,PNA)  是一种人工合成的类似于 DNA 或 RNA的聚合物。与多肽类似,各种嘌呤和嘧啶碱基通过亚甲基羰基连接到主链骨架上。由于PNA不带负电荷,与DNA和RNA之间不存在静电斥力,因而结合的稳定性和特异性都大为提高。不易被DNA酶和蛋白酶水解,PNA在体内以及体外极其稳定。

一文了解荧光标记肽核酸PNA

荧光标记标记PNA

PNA链5’端和3’端均可以标记。由于3' 端是非活性基团(-CONH2),所以需加入一个赖氨酸,其侧链上的氨基可以用来标记。

如果在5' 端标记,我们建议在PNA 和标记物之间加 1-2 O linkers。

标记物:荧光基团(—NHS酯或羧基酰胺)、生物素、棕榈酸、地高辛、DABCYL、叠氮化物、亚甲基蓝、巯基等。

<常见的荧光标记>

Dye

Ex (nm)

Em (nm)

Dye

Ex (nm)

Em (nm)

FAM

492

518

ATTO425

436

484

FITC

492

518

AlexaFlour488

494

517

OregoneGreen488

498

526

TAMRA

553

576

Cy3

550

570

TexasRed

492

576

Alexa546

556

573

Atto550

554

574

AlexaFlour532

530

555

Atto647N

644

667

Cy5

650

670

Alexa647

650

668

Thiazol Orhaige

510

530

Dabcyl

454

JOE

520

548

BHQ-2

560-670