一文了解荧光标记肽核酸PNA
肽核酸 (Peptide Nucleic Acid,PNA) 是一种人工合成的类似于 DNA 或 RNA的聚合物。与多肽类似,各种嘌呤和嘧啶碱基通过亚甲基羰基连接到主链骨架上。由于PNA不带负电荷,与DNA和RNA之间不存在静电斥力,因而结合的稳定性和特异性都大为提高。不易被DNA酶和蛋白酶水解,PNA在体内以及体外极其稳定。

荧光标记标记PNA
PNA链5’端和3’端均可以标记。由于3' 端是非活性基团(-CONH2),所以需加入一个赖氨酸,其侧链上的氨基可以用来标记。
如果在5' 端标记,我们建议在PNA 和标记物之间加 1-2 O linkers。
标记物:荧光基团(—NHS酯或羧基酰胺)、生物素、棕榈酸、地高辛、DABCYL、叠氮化物、亚甲基蓝、巯基等。
<常见的荧光标记>
Dye
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Ex (nm)
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Em (nm)
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Dye
|
Ex (nm)
|
Em (nm)
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FAM
|
492
|
518
|
ATTO425
|
436
|
484
|
FITC
|
492
|
518
|
AlexaFlour488
|
494
|
517
|
OregoneGreen488
|
498
|
526
|
TAMRA
|
553
|
576
|
Cy3
|
550
|
570
|
TexasRed
|
492
|
576
|
Alexa546
|
556
|
573
|
Atto550
|
554
|
574
|
AlexaFlour532
|
530
|
555
|
Atto647N
|
644
|
667
|
Cy5
|
650
|
670
|
Alexa647
|
650
|
668
|
Thiazol Orhaige
|
510
|
530
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Dabcyl
|
454
|
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JOE
|
520
|
548
|
BHQ-2
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560-670
|
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